13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0549 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  61.58 
 
 		 204 aa  258  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  56.16 
 
 		 204 aa  234  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  54.19 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  53.2 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  53.2 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  43.27 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  39.41 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  39.13 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  36.92 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  28.22 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  25.33 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  26.72 
 
 		 388 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>