27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2293 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  34.95 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  33.98 
 
 		 104 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  35.35 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  31.73 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  35.92 
 
 		 104 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  31.43 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  30.84 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  29.91 
 
 		 110 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  30.77 
 
 		 108 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  29.91 
 
 		 107 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  32.67 
 
 		 102 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  29.29 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  29.29 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  34.04 
 
 		 388 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  28.97 
 
 		 118 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  37.1 
 
 		 106 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  30.77 
 
 		 112 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  27.78 
 
 		 102 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  34.29 
 
 		 106 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  31.25 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  31.25 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  34.29 
 
 		 106 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  27.84 
 
 		 118 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>