42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1114 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  46 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  42 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  42.72 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  40 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  42.16 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  40.38 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  40.38 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  40.38 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  38.46 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  42.16 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  39.22 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  43.16 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  43.16 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  36.89 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  43.27 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  37 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  38.24 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  37.11 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  37.14 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  36.89 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  31 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  30.3 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  34.31 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  28.28 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  29.17 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  29.17 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  37.14 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  37.14 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  23.3 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  30.85 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  35.92 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  27.66 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  26.73 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  25.53 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  31.37 
 
 		 388 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89274  predicted protein  25.97 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0444198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49396  predicted protein  29.09 
 
 		 268 aa  42.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.699819  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  46.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2055  replication initiation regulator SeqA  35.9 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.241153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>