30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1821 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  98.15 
 
 		 108 aa  223  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  73.15 
 
 		 108 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  72.22 
 
 		 108 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  71.3 
 
 		 108 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  66.67 
 
 		 108 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  66.67 
 
 		 108 aa  153  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  65.74 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  62.96 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  61.11 
 
 		 108 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  35.58 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0089  NIPSNAP family containing protein  36.45 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5103  hypothetical protein  29.91 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0535  NIPSNAP family containing protein  29.27 
 
 		 267 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  31.48 
 
 		 104 aa  48.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  27.88 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  27.88 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  29.81 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  26.67 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  26.92 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  26.67 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  28.85 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  26.92 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  26.92 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  25.93 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  28.7 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  26.67 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  27.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1750  NIPSNAP family containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  24.53 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>