31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0973 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  226  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  86.11 
 
 		 108 aa  201  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  77.78 
 
 		 108 aa  188  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  79.63 
 
 		 108 aa  186  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  66.67 
 
 		 108 aa  153  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  65.74 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  62.96 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  61.11 
 
 		 108 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  62.04 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  53.7 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  38.24 
 
 		 262 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0089  NIPSNAP family containing protein  36.45 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0535  NIPSNAP family containing protein  39.02 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  30.77 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  30.77 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  33.33 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5103  hypothetical protein  28.04 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  30.48 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  26.85 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  29.52 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  32.43 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  26.92 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  26.19 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  26.42 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  26.51 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  26.67 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  26.42 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  27.55 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6516  NIPSNAP family containing protein  27.78 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732065  normal  0.0663973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4035  NIPSNAP family containing protein  25 
 
 		 264 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000172271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  27.71 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>