13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5103 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5103  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  240  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2371  hypothetical protein  51.89 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.165834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  29.63 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  29.91 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  29.91 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  28.97 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  28.04 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  30.84 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  28.04 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  26.17 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  28.04 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  27.1 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0089  NIPSNAP family containing protein  27.36 
 
 		 184 aa  42.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>