27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0395 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 		 262 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0089  NIPSNAP family containing protein  50 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  38.46 
 
 		 108 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  38.46 
 
 		 108 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  33.64 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  37.25 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  34.86 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  35.58 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  34.62 
 
 		 108 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  38.24 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  34.31 
 
 		 108 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4035  NIPSNAP family containing protein  24.46 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000172271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3687  NIPSNAP family containing protein  27.39 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0535  NIPSNAP family containing protein  25 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1878  NIPSNAP family containing protein  24.7 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5103  hypothetical protein  29.63 
 
 		 117 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  27.27 
 
 		 106 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6516  NIPSNAP family containing protein  31.58 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732065  normal  0.0663973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  26.85 
 
 		 102 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  25.71 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  27.27 
 
 		 106 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  27.27 
 
 		 106 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2371  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.165834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  25 
 
 		 104 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  25.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  25.47 
 
 		 105 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>