24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5794 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 108 aa  223  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  86.11 
 
 		 108 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  77.78 
 
 		 108 aa  178  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  71.3 
 
 		 108 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  62.04 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  62.96 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  58.33 
 
 		 108 aa  136  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  61.11 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  55.56 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  52.78 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  34.31 
 
 		 262 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0089  NIPSNAP family containing protein  37.38 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0535  NIPSNAP family containing protein  31.71 
 
 		 267 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  30.77 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  30.77 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  28.57 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5103  hypothetical protein  28.04 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6516  NIPSNAP family containing protein  28.7 
 
 		 270 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732065  normal  0.0663973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  30.56 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  29.36 
 
 		 113 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  25.96 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  29.13 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4035  NIPSNAP family containing protein  25.93 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000172271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  27.62 
 
 		 109 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>