38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2856 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  76.11 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  71.55 
 
 		 116 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  75.7 
 
 		 116 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  74.07 
 
 		 113 aa  167  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  69.16 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  59.26 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  59.26 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  58.33 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  58.25 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  56.48 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  51.79 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  55.56 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  57.29 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  54.26 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  54.17 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  54.17 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  51 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  46 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  45 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  45.92 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  46.94 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  44.9 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  45.92 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  44.9 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  46.39 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  44.9 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  44.9 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  42.86 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  44 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  43.56 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  39.81 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  37.78 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  43.66 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  37.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  37.33 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>