38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2540 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 103 aa  216  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  78.22 
 
 		 113 aa  173  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  67.68 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  63.64 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  64.65 
 
 		 101 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  62.63 
 
 		 101 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  62.63 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  63.64 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  61.62 
 
 		 101 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  61.62 
 
 		 101 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  59.6 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  59.6 
 
 		 101 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  59.6 
 
 		 101 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  59.41 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  57.58 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  56.44 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  52.13 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  46 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  45.54 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  56.94 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  46 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  46 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  45.36 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  45.83 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  42 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  43.3 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  46.39 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  46.39 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  41.24 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  42.71 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  36.84 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  38.54 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  38.54 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  36.46 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  36.46 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  33.67 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1204  hypothetical protein  43.64 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  29.47 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>