37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5567 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 
106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  89.22 
 
 
106 aa  192  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  70.83 
 
 
100 aa  147  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  59.41 
 
 
103 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  55.77 
 
 
105 aa  124  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  56 
 
 
101 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  57 
 
 
101 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  54 
 
 
101 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  56 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  56 
 
 
101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  56 
 
 
101 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  54 
 
 
101 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  55 
 
 
101 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  55 
 
 
101 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  55 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  53.54 
 
 
113 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  49 
 
 
110 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  43.62 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  38.78 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  38.78 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  41.41 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  52.78 
 
 
73 aa  80.1  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  38.78 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  41.05 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  36.73 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  44.68 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  42.55 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  36.46 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  38.14 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  37.5 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  36.08 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  35.35 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  36.08 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  43.06 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  37.04 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1204  hypothetical protein  48.78 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>