36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1912 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  222  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  99.07 
 
 		 107 aa  218  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  70.48 
 
 		 109 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  68.93 
 
 		 109 aa  156  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  67.31 
 
 		 109 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  66.36 
 
 		 110 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  49.51 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  54.17 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  49.51 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  54.17 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  55.32 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  46.6 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  50 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  50 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  50 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  48.96 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  46.88 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  44.9 
 
 		 145 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  45.36 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  41.24 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  38.54 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  37.5 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  36.08 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  35.05 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  36.08 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  34.02 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  35.05 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  34.02 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  32.99 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  34.02 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  34.02 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  43.06 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  32.99 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  30.93 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  31.96 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  30.43 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>