36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5018 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  215  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  66 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  67 
 
 		 116 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  64.08 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  62 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  58.25 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  57.28 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  57.28 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  58.25 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  58.25 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  58.65 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  58 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  55.21 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  54 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  53 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  54.74 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  50.51 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  48.98 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  46.88 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  46.88 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  45 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  46.94 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  46.94 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  45.54 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  44.9 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  46.94 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  46.94 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  47.47 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  46.94 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  43.56 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  43.43 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  41.18 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  41.41 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  43.08 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>