39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2901 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 
101 aa  213  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  67.33 
 
 
101 aa  157  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  71.29 
 
 
105 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  71 
 
 
101 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  70 
 
 
134 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  70 
 
 
101 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  71 
 
 
101 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  70 
 
 
101 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  68 
 
 
101 aa  153  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  66 
 
 
101 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  67.33 
 
 
101 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  64.65 
 
 
103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  63.64 
 
 
113 aa  144  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  58 
 
 
106 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  56 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  56 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  51.58 
 
 
100 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  50.51 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  51 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  51 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  59.72 
 
 
73 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  50 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  45.92 
 
 
127 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  45.92 
 
 
117 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  46 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  45.92 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  47 
 
 
113 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  46 
 
 
128 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  48 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  44.44 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  44.33 
 
 
109 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  42.42 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  39.58 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  41.24 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  41.24 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1204  hypothetical protein  37.25 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  33.33 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  29.17 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>