22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1204 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  230  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  38.46 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  42.31 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  40.79 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  40.79 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  41.1 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  39.73 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  41.1 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  41.1 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  36.59 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  39.02 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  34.57 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  33.33 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  30.77 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  38.03 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  36.62 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  32.89 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  43.9 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  26.97 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  26.67 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  25.64 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  25.97 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>