38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14430 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  206  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  74 
 
 
106 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  70.83 
 
 
106 aa  147  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  51.58 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  49.47 
 
 
101 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  52.13 
 
 
103 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  49.47 
 
 
101 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  48.42 
 
 
101 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  49.47 
 
 
105 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  47.37 
 
 
101 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  46.32 
 
 
101 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  47.37 
 
 
101 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  47.37 
 
 
134 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  47.37 
 
 
101 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  49.46 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  45.26 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  45.36 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  36.17 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  54.1 
 
 
73 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  37.36 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  36.84 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  34.04 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  42.22 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  42.22 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  41.11 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  34.04 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  34.04 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  37.78 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  37.78 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  32.99 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  38.89 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  32.97 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  31.96 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  41.18 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  30.43 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  30.43 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1204  hypothetical protein  33.87 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  31.58 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>