36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0702 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0702  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 
109 aa  224  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93029  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0647  NIPSNAP family containing protein  96.33 
 
 
109 aa  218  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.721546  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1989  NIPSNAP family protein  82.57 
 
 
109 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2461  NIPSNAP domain-containing protein  69.52 
 
 
110 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.232841 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1840  hypothetical protein  69.9 
 
 
107 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1912  hypothetical protein  68.93 
 
 
107 aa  156  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293082  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1182  hypothetical protein  59.6 
 
 
116 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.515536  normal  0.374718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2095  NIPSNAP family protein  57.41 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280163  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5419  NIPSNAP family containing protein  59.18 
 
 
116 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.65749  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  55.56 
 
 
117 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  55.56 
 
 
117 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5312  NIPSNAP family protein  55.56 
 
 
113 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0204  NIPSNAP family containing protein  50 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0203  NIPSNAP family protein  50 
 
 
127 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4262  NIPSNAP family protein  50 
 
 
127 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5018  hypothetical protein  54 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489687  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1304  NIPSNAP family protein  46.15 
 
 
128 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000755998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4485  NIPSNAP domain-containing protein  51.02 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2901  NIPSNAP family containing protein  42.42 
 
 
101 aa  84.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0756  NIPSNAP  46.39 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4415  NIPSNAP family protein  38.38 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153015  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2946  NIPSNAP family protein  40.4 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.419293  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0447  hypothetical protein  38.38 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464761  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4571  NIPSNAP family protein  38.38 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5095  NIPSNAP family protein  36.36 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.970186  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5567  NIPSNAP family containing protein  38.14 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5103  NIPSNAP family protein  36.36 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5176  NIPSNAP family protein  36.36 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0179513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3191  hypothetical protein  36.36 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2502  NIPSNAP family containing protein  36.36 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6429  NIPSNAP family containing protein  35.05 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2540  NIPSNAP family protein  36.46 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3141  NIPSNAP family protein  35.71 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630822  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0043  NIPSNAP family protein  36.36 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14430  hypothetical protein  32.99 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.924924  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3729  NIPSNAP  43.06 
 
 
73 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>