84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0206 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  100 
 
 
174 aa  344  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3865  OsmC family protein  85.06 
 
 
175 aa  256  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.745195  normal  0.175914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  40.59 
 
 
200 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  37.64 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  37.64 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  37.64 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  38.07 
 
 
188 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  34.11 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  33.06 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  29.75 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  30.87 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  31.48 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  25.36 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.92 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  28.3 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  31.48 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  25.49 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  29.03 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  32.17 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  31.63 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  31.62 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  34 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.03 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  34 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  30.66 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  29.13 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  31.63 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  31.63 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  22.8 
 
 
202 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  34.12 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  30.33 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  30.83 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  28.48 
 
 
180 aa  54.3  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  36.23 
 
 
184 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  30.58 
 
 
138 aa  54.3  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  25.69 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  29.92 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  29.1 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  26.36 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  29.81 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  32.26 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  33.33 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  28.37 
 
 
155 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  30.91 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  27.83 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  30 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  29.2 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  31.16 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  32.28 
 
 
630 aa  48.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  29.25 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  30.69 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  29.01 
 
 
134 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  27.12 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  27.88 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  33.75 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  28 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  30.3 
 
 
138 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  30.69 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  28.57 
 
 
135 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  22.63 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  24.79 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  25.56 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  25.56 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  34.88 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  25.56 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  29.7 
 
 
169 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  27.56 
 
 
180 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  31.9 
 
 
190 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  29.7 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  29.7 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  23.53 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  32.81 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  27.12 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  28.85 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  31.03 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  29.81 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  28.71 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  28.95 
 
 
169 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  26.55 
 
 
131 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  28.12 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  26.85 
 
 
168 aa  41.6  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  27.62 
 
 
137 aa  41.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  32.1 
 
 
185 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  32.26 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>