More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03750 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03750  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  732    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.32469  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2354  cobalamin synthesis protein, P47K  52.29 
 
 
367 aa  333  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0783828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  33.78 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.98 
 
 
344 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  46.28 
 
 
348 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.38 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  34.72 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  41.48 
 
 
346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  39.38 
 
 
354 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.38 
 
 
355 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.94 
 
 
354 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.71 
 
 
349 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.38 
 
 
386 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  31.96 
 
 
344 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.99 
 
 
358 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.25 
 
 
350 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.09 
 
 
355 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  31.4 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.71 
 
 
335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  39.39 
 
 
357 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.98 
 
 
334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.17 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.61 
 
 
349 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.78 
 
 
357 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.78 
 
 
357 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.78 
 
 
369 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.78 
 
 
390 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.78 
 
 
357 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.78 
 
 
357 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.78 
 
 
357 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.78 
 
 
357 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  33.33 
 
 
367 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.75 
 
 
348 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  33.15 
 
 
345 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.69 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.91 
 
 
358 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.91 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.35 
 
 
363 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.06 
 
 
344 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.15 
 
 
369 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.52 
 
 
349 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  32.53 
 
 
362 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  31.02 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  32.61 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.61 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.23 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.07 
 
 
362 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.78 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.32 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.77 
 
 
349 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.53 
 
 
362 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.98 
 
 
362 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.32 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  30.77 
 
 
349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.36 
 
 
344 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.99 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.38 
 
 
343 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.87 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.83 
 
 
345 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.65 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.48 
 
 
344 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.06 
 
 
344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  37.07 
 
 
344 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  35.29 
 
 
371 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  37.95 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.92 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.87 
 
 
349 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.28 
 
 
345 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  31.28 
 
 
345 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  36.44 
 
 
351 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  39 
 
 
364 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  29.54 
 
 
358 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.26 
 
 
337 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  37.34 
 
 
369 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.38 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  33.62 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.5 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.32 
 
 
348 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  31.83 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  39.58 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  36.19 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  34.89 
 
 
350 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.6 
 
 
353 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  38.92 
 
 
328 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  33.19 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.6 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  35.98 
 
 
449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  34.85 
 
 
452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  27.62 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.03 
 
 
353 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.71 
 
 
350 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.6 
 
 
345 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  34.49 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  34.01 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.6 
 
 
350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.71 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  29.61 
 
 
320 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  34.11 
 
 
449 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  33.85 
 
 
354 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  36.22 
 
 
369 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>