More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2354 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2354  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 367 aa  736    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0783828  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03750  hypothetical protein  52.29 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.32469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.39 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.33 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.21 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  37.89 
 
 		 375 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.55 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.34 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.49 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  31.71 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  37.44 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.48 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.48 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.48 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.86 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.8 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  37 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.8 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.8 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.44 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.27 
 
 		 363 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.8 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.49 
 
 		 390 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37 
 
 		 354 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.8 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  34.29 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.23 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.37 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  28.23 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  32.35 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.75 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.65 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.16 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  30.97 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  38.89 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.46 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.96 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.46 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  38.03 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.03 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  29.73 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  32.45 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.85 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.06 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.52 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.81 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  28.85 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.3 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  35.19 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  37.91 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.12 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.52 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  30.98 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.61 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.53 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  38.03 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  30.16 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  40 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.05 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.92 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  37.91 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  38.86 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.72 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  40 
 
 		 460 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.2 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  32.15 
 
 		 349 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  36.11 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.11 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  30.17 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  36.68 
 
 		 361 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  28.8 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  37.81 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  38 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  29.04 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  29.23 
 
 		 323 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  31.02 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  26.87 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.44 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  28.77 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  37.44 
 
 		 353 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.12 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  28.61 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  38.86 
 
 		 460 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  31.54 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.4 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  37.7 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.53 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  37.82 
 
 		 457 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  27.23 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.33 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.59 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.78 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>