155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0054 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0054  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 494 aa  999    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0053  permease YjgP/YjgQ  56.2 
 
 		 428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0045  hypothetical protein  55.97 
 
 		 416 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.402941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 371 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  28.91 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  29.98 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  27.75 
 
 		 372 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  28.14 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  27.16 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  27.06 
 
 		 375 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  28.54 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  38.25 
 
 		 367 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.54 
 
 		 360 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  28.37 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  37.71 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  24.75 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.52 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  24.76 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.04 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  32.84 
 
 		 370 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  32.84 
 
 		 370 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  32.84 
 
 		 370 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 370 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  27.14 
 
 		 370 aa  87  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  29.21 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  32.6 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  31.34 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  23.18 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  27.92 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  27.35 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  27.53 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  31.17 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  23.6 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  24.78 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  24.78 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  28.4 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  31.15 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  21.58 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  29.01 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  22.3 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  22.3 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  23.38 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  33.99 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  23.38 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  23.38 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  22.78 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  22.83 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  23.38 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  22.78 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  22.78 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  26.51 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  26.74 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  27.37 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  26.74 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  26.7 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  25.77 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  26.74 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  27.84 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  26.74 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  26.74 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  26.74 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  26.74 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 367 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  31.34 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  30.86 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  20.43 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  23.46 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  27.13 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  27.23 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  27.23 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  31.34 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.53 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 360 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 372 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  26.98 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  28.89 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  34.95 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  32.84 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  29.55 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  29.53 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  34.45 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  24.48 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  27.27 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  28.11 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  23.86 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3719  permease YjgP/YjgQ family protein  28.5 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>