More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3236 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06346  hypothetical dihydroxy-acid dehydratase (Eurofung)  65.32 
 
 		 613 aa  742    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0344315 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20547  homeobox protein  67.39 
 
 		 555 aa  781    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  68.47 
 
 		 571 aa  804    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01530  dihydroxy-acid dehydratase, putative  61.2 
 
 		 596 aa  701    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.454671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2863  dihydroxy-acid dehydratase  62.7 
 
 		 557 aa  715    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0663507  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75802  dihydroxyacid dehydratase  59.4 
 
 		 604 aa  688    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3684  dihydroxy-acid dehydratase  59.43 
 
 		 561 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0646583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3418  dihydroxy-acid dehydratase  62.41 
 
 		 565 aa  711    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3745  dihydroxy-acid dehydratase  61.62 
 
 		 562 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1920  dihydroxy-acid dehydratase  64.09 
 
 		 559 aa  738    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1312  dihydroxy-acid dehydratase  59.43 
 
 		 570 aa  654    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.462059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5915  dihydroxy-acid dehydratase  60.32 
 
 		 569 aa  685    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3236  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 557 aa  1146    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000356342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2151  dihydroxy-acid dehydratase  63.13 
 
 		 561 aa  724    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.950442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34354  predicted protein  70.61 
 
 		 567 aa  818    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.311045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  54.43 
 
 		 562 aa  598  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2664  dihydroxy-acid dehydratase  55.88 
 
 		 570 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  54.25 
 
 		 558 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 		 564 aa  568  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04058  hypothetical dihydroxyacid dehydratase (Eurofung)  51.92 
 
 		 603 aa  565  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0138326 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3020  dihydroxy-acid dehydratase  52.68 
 
 		 574 aa  558  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  51.44 
 
 		 567 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 561 aa  551  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 557 aa  548  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 563 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 557 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 563 aa  541  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 		 561 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 		 561 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 568 aa  538  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 		 557 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 		 557 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 561 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 		 563 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 556 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 560 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 		 564 aa  535  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 562 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 557 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 563 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 564 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 559 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 		 556 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  47.84 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 		 560 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 564 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 		 567 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 557 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2334  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00290796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  48.03 
 
 		 557 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 557 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  50.74 
 
 		 572 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 561 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1566  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 567 aa  526  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 558 aa  528  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  47.4 
 
 		 564 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 		 557 aa  525  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  48.74 
 
 		 557 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 557 aa  522  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  48.38 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 557 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 557 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 		 565 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 565 aa  524  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 564 aa  525  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 573 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  48.03 
 
 		 556 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  48.03 
 
 		 556 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  48.57 
 
 		 570 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2221  dihydroxy-acid dehydratase  48.56 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  48.84 
 
 		 582 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 		 569 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 		 575 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 		 579 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  47.02 
 
 		 573 aa  509  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  48.12 
 
 		 570 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 		 580 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  47.32 
 
 		 564 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 		 580 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 		 575 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 		 571 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 		 580 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 589 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>