127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1728 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1728  epocide hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
396 aa  818    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1741  epocide hydrolase domain-containing protein  46.7 
 
 
398 aa  348  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5889  epocide hydrolase domain-containing protein  45.65 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518696  normal  0.269579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0357  epocide hydrolase domain-containing protein  43.19 
 
 
369 aa  308  8e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1727  epocide hydrolase domain-containing protein  40.51 
 
 
407 aa  292  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  41.58 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  41.58 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  41.58 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  41.58 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  41.58 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  41.58 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  41.58 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  38.97 
 
 
383 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1982  epocide hydrolase domain-containing protein  39.29 
 
 
393 aa  282  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  42.96 
 
 
367 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  42.96 
 
 
367 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  42.96 
 
 
367 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  37.91 
 
 
383 aa  279  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  42.09 
 
 
380 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  40.85 
 
 
385 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  42.2 
 
 
367 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  38.32 
 
 
384 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  40.41 
 
 
367 aa  266  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  38.73 
 
 
383 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  38.48 
 
 
378 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  40.82 
 
 
382 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  39.56 
 
 
387 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  39.85 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  38.94 
 
 
383 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  38.42 
 
 
391 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  41.07 
 
 
383 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  38.14 
 
 
389 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  40.31 
 
 
382 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  40.31 
 
 
382 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  37.21 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  37.44 
 
 
383 aa  252  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  35.17 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  34.98 
 
 
445 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  36.78 
 
 
383 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  35.89 
 
 
448 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2690  Epoxide hydrolase domain protein  33.42 
 
 
420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  36.99 
 
 
372 aa  235  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  36.68 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  35.59 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  36.18 
 
 
379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  33.25 
 
 
425 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  34.94 
 
 
374 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  33.75 
 
 
446 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  35.28 
 
 
410 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  34.92 
 
 
387 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  38.01 
 
 
423 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  35.24 
 
 
390 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  33.17 
 
 
438 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  35.51 
 
 
436 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  36.93 
 
 
368 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  34.58 
 
 
431 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  36.8 
 
 
383 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  34.58 
 
 
428 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  35.02 
 
 
442 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  36.39 
 
 
366 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  33.49 
 
 
426 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  35.44 
 
 
391 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  33.16 
 
 
444 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1877  Epoxide hydrolase domain protein  36.36 
 
 
361 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  33.94 
 
 
403 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  33.83 
 
 
425 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5065  Epoxide hydrolase domain-containing protein  33.84 
 
 
362 aa  215  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  34.26 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  33.08 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  35.73 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  32.35 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  34.01 
 
 
425 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  33.08 
 
 
425 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  37 
 
 
376 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  32.68 
 
 
450 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  34.42 
 
 
374 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  32.13 
 
 
474 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  33.82 
 
 
433 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  33.42 
 
 
409 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  33.01 
 
 
503 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  33.84 
 
 
409 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1214  putative hydrolase  34.52 
 
 
376 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  33.5 
 
 
378 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2973  Microsomal epoxide hydrolase  31.63 
 
 
422 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  34.92 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.298579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8896  Epoxide hydrolase domain protein  35.82 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3427  Epoxide hydrolase domain protein  32.54 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000739358  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3339  Epoxide hydrolase domain protein  34.73 
 
 
376 aa  201  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0285  Epoxide hydrolase domain protein  33.59 
 
 
384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  33.6 
 
 
395 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6640  epocide hydrolase domain-containing protein  36.52 
 
 
323 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  33.58 
 
 
435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5081  Epoxide hydrolase domain protein  32.37 
 
 
451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548247  hitchhiker  0.00364616 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5519  epocide hydrolase domain-containing protein  32.76 
 
 
430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4618  putative epoxide hydrolase  33.09 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  33.67 
 
 
441 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6857  Epoxide hydrolase domain protein  33.5 
 
 
431 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2691  Microsomal epoxide hydrolase  33.83 
 
 
380 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1066  epocide hydrolase domain-containing protein  31.27 
 
 
380 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>