140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2254 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  100 
 
 
444 aa  908    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  76.25 
 
 
446 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  77.55 
 
 
445 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  69.5 
 
 
429 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  65.73 
 
 
438 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  57.82 
 
 
425 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  57.35 
 
 
425 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  57.55 
 
 
425 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  57.58 
 
 
425 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  61.06 
 
 
431 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  57.31 
 
 
425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  60.4 
 
 
428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  55.18 
 
 
448 aa  511  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  58.94 
 
 
425 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  60.15 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  61.87 
 
 
503 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  55.28 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  56.57 
 
 
441 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5081  Epoxide hydrolase domain protein  55.45 
 
 
451 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548247  hitchhiker  0.00364616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  55.28 
 
 
426 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7708  epoxide hydrolase  55.7 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303595  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  51.47 
 
 
450 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  51.37 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  51.96 
 
 
435 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  51.88 
 
 
432 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  51.68 
 
 
433 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  51.66 
 
 
391 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5519  epocide hydrolase domain-containing protein  51.36 
 
 
430 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  48.97 
 
 
391 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6857  Epoxide hydrolase domain protein  48.12 
 
 
431 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  47.71 
 
 
423 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  47.34 
 
 
377 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  47.34 
 
 
380 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  47.34 
 
 
380 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  47.34 
 
 
380 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  47.34 
 
 
380 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  47.34 
 
 
377 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  47.34 
 
 
377 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  48.7 
 
 
377 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  47.34 
 
 
380 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  47.45 
 
 
367 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  47.45 
 
 
367 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  47.45 
 
 
367 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  46.15 
 
 
409 aa  348  8e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  47.19 
 
 
387 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  45.52 
 
 
385 aa  345  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  45.13 
 
 
367 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  45.01 
 
 
367 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4618  putative epoxide hydrolase  43.28 
 
 
399 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  43.99 
 
 
383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  44.84 
 
 
378 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0285  Epoxide hydrolase domain protein  43.26 
 
 
384 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  41.88 
 
 
383 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  45.41 
 
 
383 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  44.19 
 
 
368 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  39.74 
 
 
410 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  42.01 
 
 
395 aa  299  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  41.62 
 
 
383 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  40.51 
 
 
389 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  40.51 
 
 
383 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  37.65 
 
 
403 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  41.28 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  41.84 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  38.62 
 
 
387 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  39.9 
 
 
382 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  39.9 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  39.9 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  38.62 
 
 
385 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  38.24 
 
 
383 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  38.3 
 
 
368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  38.07 
 
 
379 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  37.53 
 
 
386 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1239  putative hydrolase  39.24 
 
 
393 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  37.22 
 
 
383 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  39.09 
 
 
374 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  37.24 
 
 
375 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.298579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0154  Epoxide hydrolase domain protein  36.99 
 
 
376 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  41.38 
 
 
383 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  39.04 
 
 
388 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3427  Epoxide hydrolase domain protein  35.34 
 
 
417 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000739358  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  39.03 
 
 
372 aa  256  7e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  37.66 
 
 
378 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2973  Microsomal epoxide hydrolase  35.96 
 
 
422 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3339  Epoxide hydrolase domain protein  38.05 
 
 
376 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  36.15 
 
 
384 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  36.39 
 
 
390 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2787  Microsomal epoxide hydrolase  35.57 
 
 
384 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5065  Epoxide hydrolase domain-containing protein  37.91 
 
 
362 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1066  epocide hydrolase domain-containing protein  36.18 
 
 
380 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1214  putative hydrolase  37.34 
 
 
376 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8896  Epoxide hydrolase domain protein  36.41 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  34.11 
 
 
403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2691  Microsomal epoxide hydrolase  36.43 
 
 
380 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2023  Microsomal epoxide hydrolase  35.99 
 
 
411 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4378  epocide hydrolase domain-containing protein  35.66 
 
 
380 aa  240  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.925991  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3385  Epoxide hydrolase domain-containing protein  35.09 
 
 
375 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6640  epocide hydrolase domain-containing protein  39.08 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4152  epocide hydrolase domain-containing protein  34.86 
 
 
411 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  35.26 
 
 
376 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2199  epoxide hydrolase-like  35.21 
 
 
419 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>