148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5719 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 425 aa  881    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  63.23 
 
 		 425 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  63.23 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  62.76 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  62.3 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  62.06 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  61.9 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  60.33 
 
 		 428 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  62.56 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  58.63 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  58.94 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  54.28 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  56.03 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  53.65 
 
 		 438 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  58.06 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  55.26 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  54.08 
 
 		 442 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  54.75 
 
 		 450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  52.29 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  53.27 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  53.35 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  51.41 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  53.3 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5081  Epoxide hydrolase domain protein  52.7 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548247  hitchhiker  0.00364616 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7708  epoxide hydrolase  52.35 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5519  epocide hydrolase domain-containing protein  53.09 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6857  Epoxide hydrolase domain protein  50.47 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  52.71 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  49.65 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  47.56 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  47.46 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  47.46 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  47.46 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  47.46 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  47.56 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  47.56 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  49.1 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  47.46 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  46.3 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  47.81 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  46.77 
 
 		 367 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  46.77 
 
 		 367 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  46.77 
 
 		 367 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  46.27 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  47.19 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  44.8 
 
 		 409 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  44.7 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  41.69 
 
 		 385 aa  335  9e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  42.31 
 
 		 383 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  43.15 
 
 		 378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4618  putative epoxide hydrolase  43.15 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  40.83 
 
 		 383 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  39.85 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  42.22 
 
 		 395 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0285  Epoxide hydrolase domain protein  39.59 
 
 		 384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  43.91 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  41.65 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  43.64 
 
 		 368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  39.74 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  40.51 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  39.38 
 
 		 368 aa  292  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  38.44 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  38.97 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  37.95 
 
 		 387 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  39.23 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.03 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  39.31 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  40.36 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  38.79 
 
 		 382 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  38.79 
 
 		 382 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  37.91 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  39.84 
 
 		 383 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2787  Microsomal epoxide hydrolase  36.72 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  38.6 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  35.46 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  40.26 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1214  putative hydrolase  38.21 
 
 		 376 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  36.57 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5065  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.02 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  35.23 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3427  Epoxide hydrolase domain protein  33.25 
 
 		 417 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000739358  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  35.64 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.298579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  36.07 
 
 		 386 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0154  Epoxide hydrolase domain protein  34.35 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8896  Epoxide hydrolase domain protein  35.68 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1239  putative hydrolase  37.44 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2691  Microsomal epoxide hydrolase  37.24 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  37.21 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1741  epocide hydrolase domain-containing protein  37.03 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2973  Microsomal epoxide hydrolase  34.8 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  36.05 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2690  Epoxide hydrolase domain protein  36.23 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6640  epocide hydrolase domain-containing protein  38.33 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1066  epocide hydrolase domain-containing protein  35.2 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  36.15 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  34.12 
 
 		 409 aa  236  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3339  Epoxide hydrolase domain protein  36.15 
 
 		 376 aa  235  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  33.59 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4378  epocide hydrolase domain-containing protein  35.62 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.925991  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1728  epocide hydrolase domain-containing protein  33.25 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>