192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5519 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6857  Epoxide hydrolase domain protein  83.99 
 
 		 431 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  78.25 
 
 		 433 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5519  epocide hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 430 aa  884    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  75.93 
 
 		 432 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  70.92 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7708  epoxide hydrolase  68.88 
 
 		 443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  63.41 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  60.95 
 
 		 426 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  59.31 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  54.59 
 
 		 450 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5081  Epoxide hydrolase domain protein  55.29 
 
 		 451 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548247  hitchhiker  0.00364616 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  57.31 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  57.25 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  52.9 
 
 		 425 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  52.67 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  52.2 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  50.78 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  53.27 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  57.21 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  51.74 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  52.35 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  54.7 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  54.48 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  51.51 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  53.81 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  53.77 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  51.28 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  49.2 
 
 		 444 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  48.48 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  47.33 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  45.75 
 
 		 423 aa  345  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  46.45 
 
 		 377 aa  342  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  43.39 
 
 		 387 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  44.08 
 
 		 377 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  44.08 
 
 		 380 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  44.08 
 
 		 380 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  44.08 
 
 		 380 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  44.08 
 
 		 380 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  44.08 
 
 		 377 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  44.08 
 
 		 377 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  44.33 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  42.89 
 
 		 385 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  45.86 
 
 		 367 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  45.86 
 
 		 367 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  45.86 
 
 		 367 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  46.56 
 
 		 367 aa  319  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  45.96 
 
 		 367 aa  316  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  44.55 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  40.31 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4618  putative epoxide hydrolase  40.55 
 
 		 399 aa  299  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  44.67 
 
 		 383 aa  298  9e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  43.54 
 
 		 378 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.9 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  39.37 
 
 		 403 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  39.04 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0285  Epoxide hydrolase domain protein  40.46 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  41.22 
 
 		 374 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  40.36 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  38.56 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  38.11 
 
 		 368 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  36.68 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  37.91 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  38.18 
 
 		 386 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  37.22 
 
 		 378 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  38.54 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1239  putative hydrolase  38.99 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  36.04 
 
 		 387 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0154  Epoxide hydrolase domain protein  36.9 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5065  Epoxide hydrolase domain-containing protein  40.31 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3339  Epoxide hydrolase domain protein  36.27 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  37.56 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  37.94 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  38.01 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2787  Microsomal epoxide hydrolase  34.78 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6640  epocide hydrolase domain-containing protein  40.62 
 
 		 323 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2973  Microsomal epoxide hydrolase  35.55 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  37.72 
 
 		 366 aa  234  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1214  putative hydrolase  36.48 
 
 		 376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  36.52 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  36.2 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  36.29 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  35.94 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  35.94 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  34.75 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  36.52 
 
 		 372 aa  226  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  34.44 
 
 		 375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.298579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1727  epocide hydrolase domain-containing protein  36.32 
 
 		 407 aa  222  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8896  Epoxide hydrolase domain protein  33.84 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  37.25 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  35.82 
 
 		 376 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3427  Epoxide hydrolase domain protein  34.52 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000739358  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  32.99 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  33.25 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3385  Epoxide hydrolase domain-containing protein  33.66 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  35.29 
 
 		 384 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  34.25 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1741  epocide hydrolase domain-containing protein  35.57 
 
 		 398 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1066  epocide hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2691  Microsomal epoxide hydrolase  32.44 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116315 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05262  Epoxide hydrolase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2KHJ7]  33.91 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>