More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1066 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2691  Microsomal epoxide hydrolase  82.63 
 
 
380 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4378  epocide hydrolase domain-containing protein  87.11 
 
 
380 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.925991  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1066  epocide hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  781    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  47.66 
 
 
378 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  45.62 
 
 
376 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  44.87 
 
 
388 aa  325  7e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  47.77 
 
 
368 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  44 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  45.81 
 
 
366 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  43.47 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  44.79 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  43.33 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  43.37 
 
 
385 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1214  putative hydrolase  43.16 
 
 
376 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  43.08 
 
 
374 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  44.78 
 
 
410 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2973  Microsomal epoxide hydrolase  39.91 
 
 
422 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  41.77 
 
 
383 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0285  Epoxide hydrolase domain protein  42.13 
 
 
384 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  40.93 
 
 
367 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  40.93 
 
 
367 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  40.93 
 
 
367 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  42.42 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  43.35 
 
 
367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  41.52 
 
 
368 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  40.68 
 
 
367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  40.3 
 
 
375 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.298579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3385  Epoxide hydrolase domain-containing protein  40.25 
 
 
375 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  39.36 
 
 
386 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  38.07 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  38.07 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  38.07 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  38.07 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  38.3 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  38.3 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  38.3 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  37.23 
 
 
403 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1239  putative hydrolase  39.34 
 
 
393 aa  262  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  40.36 
 
 
391 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  38.58 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  38.32 
 
 
380 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  36.92 
 
 
428 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5065  Epoxide hydrolase domain-containing protein  40.74 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3339  Epoxide hydrolase domain protein  39.09 
 
 
376 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2787  Microsomal epoxide hydrolase  36.78 
 
 
384 aa  245  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117815  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  35.82 
 
 
425 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  36.18 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  35.82 
 
 
425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  37.8 
 
 
395 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  34.7 
 
 
383 aa  242  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  35.73 
 
 
425 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  35.15 
 
 
431 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  35.32 
 
 
425 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  35.2 
 
 
425 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 
425 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  38.26 
 
 
379 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  37.97 
 
 
385 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  35.94 
 
 
450 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  34.92 
 
 
448 aa  236  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  35.68 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  34.94 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  34.25 
 
 
445 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0154  Epoxide hydrolase domain protein  37.63 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  36.83 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  37.19 
 
 
474 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  37.63 
 
 
391 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  35.48 
 
 
503 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  36.36 
 
 
409 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  35.11 
 
 
436 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  35.01 
 
 
429 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4618  putative epoxide hydrolase  36.72 
 
 
399 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5081  Epoxide hydrolase domain protein  34.25 
 
 
451 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548247  hitchhiker  0.00364616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  33 
 
 
432 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8896  Epoxide hydrolase domain protein  35.82 
 
 
367 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  33.75 
 
 
438 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  34.06 
 
 
435 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  34.63 
 
 
383 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  34.2 
 
 
423 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7708  epoxide hydrolase  34.1 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303595  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1691  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.95 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  37.22 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  37.53 
 
 
382 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  34.38 
 
 
383 aa  215  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  32.49 
 
 
441 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  37.28 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  37.28 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  33.5 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  35.99 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  34.78 
 
 
383 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  32.82 
 
 
384 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6640  epocide hydrolase domain-containing protein  36.83 
 
 
323 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  35.61 
 
 
390 aa  205  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  32.91 
 
 
426 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  31.75 
 
 
433 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5519  epocide hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 
430 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  34.61 
 
 
403 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  36.16 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2690  Epoxide hydrolase domain protein  34.49 
 
 
420 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1728  epocide hydrolase domain-containing protein  31.27 
 
 
396 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6857  Epoxide hydrolase domain protein  30.23 
 
 
431 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>