160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3443 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  96.23 
 
 
425 aa  847    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  99.76 
 
 
425 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  96.23 
 
 
425 aa  846    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  96.7 
 
 
425 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
425 aa  875    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  64.45 
 
 
428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  64.93 
 
 
431 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  62.06 
 
 
425 aa  568  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  63.82 
 
 
446 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  62.6 
 
 
448 aa  524  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  60.81 
 
 
445 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  59.7 
 
 
438 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  57.35 
 
 
444 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  57.11 
 
 
442 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  60.29 
 
 
474 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  60.55 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5081  Epoxide hydrolase domain protein  54.61 
 
 
451 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548247  hitchhiker  0.00364616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  57.53 
 
 
450 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  54.25 
 
 
432 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  52.73 
 
 
429 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  57.65 
 
 
441 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  54.19 
 
 
436 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  54.44 
 
 
433 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7708  epoxide hydrolase  56.56 
 
 
443 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303595  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  51.96 
 
 
435 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  48.82 
 
 
426 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5519  epocide hydrolase domain-containing protein  52.07 
 
 
430 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6857  Epoxide hydrolase domain protein  49.42 
 
 
431 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  50.9 
 
 
391 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  51.43 
 
 
391 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  50 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  49.61 
 
 
377 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  48.05 
 
 
377 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  48.05 
 
 
380 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  48.05 
 
 
380 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  48.05 
 
 
380 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  48.05 
 
 
380 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  48.05 
 
 
377 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  48.05 
 
 
377 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  48.05 
 
 
380 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  45.78 
 
 
385 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  46.04 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  46.51 
 
 
367 aa  342  7e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  46.51 
 
 
367 aa  342  7e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  46.51 
 
 
367 aa  342  7e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  44.82 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  46.11 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  45.19 
 
 
367 aa  332  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  47.47 
 
 
409 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  45.36 
 
 
378 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  45.2 
 
 
383 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4618  putative epoxide hydrolase  44.27 
 
 
399 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  41.3 
 
 
383 aa  309  8e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  42.71 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0285  Epoxide hydrolase domain protein  41.9 
 
 
384 aa  306  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  41.64 
 
 
395 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  39.12 
 
 
403 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  42.42 
 
 
389 aa  294  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  43.08 
 
 
368 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.53 
 
 
383 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  40.66 
 
 
383 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  39.49 
 
 
385 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  40.72 
 
 
374 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  39.59 
 
 
383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  37.69 
 
 
368 aa  272  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  39.69 
 
 
379 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  38.72 
 
 
387 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  40.62 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  40.15 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  38.54 
 
 
386 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1239  putative hydrolase  40.92 
 
 
393 aa  266  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2787  Microsomal epoxide hydrolase  35.99 
 
 
384 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117815  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  38.46 
 
 
383 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  38.32 
 
 
388 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  38.95 
 
 
382 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  38.95 
 
 
382 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  39.9 
 
 
374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2973  Microsomal epoxide hydrolase  36.64 
 
 
422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  38.16 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3427  Epoxide hydrolase domain protein  34.52 
 
 
417 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000739358  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1214  putative hydrolase  37.12 
 
 
376 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0154  Epoxide hydrolase domain protein  37.05 
 
 
376 aa  249  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  37.47 
 
 
376 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  39.31 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3339  Epoxide hydrolase domain protein  38.38 
 
 
376 aa  246  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  40 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  36.18 
 
 
375 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.298579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  35.25 
 
 
403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5065  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.02 
 
 
362 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8896  Epoxide hydrolase domain protein  36.5 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  36.8 
 
 
390 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1066  epocide hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 
380 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  35.2 
 
 
384 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6640  epocide hydrolase domain-containing protein  38.84 
 
 
323 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2691  Microsomal epoxide hydrolase  38.01 
 
 
380 aa  235  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1727  epocide hydrolase domain-containing protein  36.5 
 
 
407 aa  233  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3385  Epoxide hydrolase domain-containing protein  34.16 
 
 
375 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  34.72 
 
 
409 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4378  epocide hydrolase domain-containing protein  36.46 
 
 
380 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.925991  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1741  epocide hydrolase domain-containing protein  35.68 
 
 
398 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>