192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2199 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2199  epoxide hydrolase-like  100 
 
 
419 aa  857    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4152  epocide hydrolase domain-containing protein  69.08 
 
 
411 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2023  Microsomal epoxide hydrolase  68.07 
 
 
411 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  43.28 
 
 
390 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3427  Epoxide hydrolase domain protein  40.24 
 
 
417 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000739358  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  37.25 
 
 
384 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  39.47 
 
 
383 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  37.1 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  35.63 
 
 
445 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  36.97 
 
 
372 aa  236  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  35.91 
 
 
377 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  35.91 
 
 
380 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  35.91 
 
 
380 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  35.91 
 
 
380 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  35.91 
 
 
380 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  35.91 
 
 
377 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  35.91 
 
 
377 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  34.65 
 
 
383 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  35.34 
 
 
387 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  36.86 
 
 
383 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  35.06 
 
 
446 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  36.3 
 
 
379 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  34.73 
 
 
388 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  35.64 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  33.66 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1741  epocide hydrolase domain-containing protein  35.8 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  36.84 
 
 
382 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  36.84 
 
 
382 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  33.66 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  34.47 
 
 
444 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  36.46 
 
 
382 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  35.77 
 
 
474 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  33.49 
 
 
403 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  31.41 
 
 
425 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  35.15 
 
 
374 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  34.08 
 
 
383 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  35.66 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  34.98 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  34.98 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  34.98 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1727  epocide hydrolase domain-containing protein  34.77 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  34.9 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  33.82 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  34.55 
 
 
385 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  32.92 
 
 
383 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  31.37 
 
 
429 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  32.43 
 
 
431 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  33.72 
 
 
426 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  32.71 
 
 
423 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  32.29 
 
 
391 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  39.33 
 
 
383 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  33.74 
 
 
389 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  35.04 
 
 
386 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2973  Microsomal epoxide hydrolase  37.86 
 
 
422 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  33.25 
 
 
409 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0357  epocide hydrolase domain-containing protein  34.49 
 
 
369 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  34.29 
 
 
441 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7708  epoxide hydrolase  34.86 
 
 
443 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303595  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  31.45 
 
 
425 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  33.99 
 
 
367 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  33.49 
 
 
503 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  34.83 
 
 
403 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  33.65 
 
 
432 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  30.82 
 
 
450 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  30.71 
 
 
425 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  31.68 
 
 
448 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  32.75 
 
 
383 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  31.2 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  32.02 
 
 
391 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  34.33 
 
 
367 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  30.71 
 
 
425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  30.47 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2690  Epoxide hydrolase domain protein  33.65 
 
 
420 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1214  putative hydrolase  32.01 
 
 
376 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  32.59 
 
 
409 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  33.17 
 
 
433 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  30.37 
 
 
377 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  32.38 
 
 
442 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  32.76 
 
 
378 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  31.32 
 
 
410 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  32.32 
 
 
387 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  31.68 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5081  Epoxide hydrolase domain protein  31.1 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548247  hitchhiker  0.00364616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  33.41 
 
 
435 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  32.26 
 
 
374 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1066  epocide hydrolase domain-containing protein  36.96 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164986  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0285  Epoxide hydrolase domain protein  32.54 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1239  putative hydrolase  31.27 
 
 
393 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3356  epoxide hydrolase-like  34.72 
 
 
383 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21914  normal  0.116129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1691  Epoxide hydrolase domain-containing protein  33.74 
 
 
377 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  31.68 
 
 
366 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2787  Microsomal epoxide hydrolase  33.09 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117815  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2691  Microsomal epoxide hydrolase  32.6 
 
 
380 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5519  epocide hydrolase domain-containing protein  31.68 
 
 
430 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  31.11 
 
 
368 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1728  epocide hydrolase domain-containing protein  30.84 
 
 
396 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4378  epocide hydrolase domain-containing protein  33.09 
 
 
380 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.925991  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  32.42 
 
 
376 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  32.16 
 
 
375 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.298579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  30.95 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>