271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0357 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0357  epocide hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  746    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1741  epocide hydrolase domain-containing protein  46.42 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1728  epocide hydrolase domain-containing protein  43.19 
 
 
396 aa  308  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  44.44 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  44.44 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  44.44 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  42.63 
 
 
383 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  43.56 
 
 
367 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  42.41 
 
 
383 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1727  epocide hydrolase domain-containing protein  38.42 
 
 
407 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  43.24 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  41.95 
 
 
377 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  41.95 
 
 
377 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  41.95 
 
 
377 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  41.95 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  41.95 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  41.95 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  41.95 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  43.35 
 
 
380 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  46.36 
 
 
382 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  43.54 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  46.06 
 
 
382 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  46.06 
 
 
382 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5889  epocide hydrolase domain-containing protein  43.53 
 
 
376 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518696  normal  0.269579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  40.36 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  44.93 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  39.31 
 
 
384 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  41.78 
 
 
383 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  40.36 
 
 
385 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.32 
 
 
383 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  39.23 
 
 
390 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  40.84 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  43.09 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  39.42 
 
 
377 aa  243  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  40.05 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  39.42 
 
 
383 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  38.6 
 
 
391 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  38.11 
 
 
438 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  36.51 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  39.02 
 
 
385 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  40.46 
 
 
383 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  37 
 
 
403 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  37.15 
 
 
445 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  37.05 
 
 
428 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  38.64 
 
 
446 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  40.31 
 
 
389 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  38.65 
 
 
391 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1691  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.74 
 
 
377 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  38.9 
 
 
372 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4292  Epoxide hydrolase domain protein  39.29 
 
 
362 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2690  Epoxide hydrolase domain protein  34.37 
 
 
420 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  35.22 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  38.08 
 
 
425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  40.61 
 
 
409 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  38.62 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  39.94 
 
 
425 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  37.06 
 
 
403 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1982  epocide hydrolase domain-containing protein  36 
 
 
393 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5065  Epoxide hydrolase domain-containing protein  39.84 
 
 
362 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  40.7 
 
 
423 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  34.4 
 
 
409 aa  216  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  38.81 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  35.88 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4618  putative epoxide hydrolase  37.82 
 
 
399 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  36.55 
 
 
383 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  36.55 
 
 
435 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  38.53 
 
 
425 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  39.09 
 
 
425 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  35.94 
 
 
448 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  38.81 
 
 
425 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  37.5 
 
 
374 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  35.44 
 
 
429 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  35.46 
 
 
436 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 
395 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1214  putative hydrolase  37.99 
 
 
376 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.260991 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05262  Epoxide hydrolase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2KHJ7]  34.42 
 
 
419 aa  206  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5081  Epoxide hydrolase domain protein  36.34 
 
 
451 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548247  hitchhiker  0.00364616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2199  epoxide hydrolase-like  34.49 
 
 
419 aa  205  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  35.38 
 
 
410 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0285  Epoxide hydrolase domain protein  37.56 
 
 
384 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  36.15 
 
 
368 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  36.18 
 
 
474 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  36.25 
 
 
503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  36.97 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  36.68 
 
 
450 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  36.62 
 
 
378 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  35.52 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2023  Microsomal epoxide hydrolase  33.83 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6640  epocide hydrolase domain-containing protein  41.18 
 
 
323 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4152  epocide hydrolase domain-containing protein  33.17 
 
 
411 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0493973  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  33.84 
 
 
426 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1877  Epoxide hydrolase domain protein  36.56 
 
 
361 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119141  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  34.66 
 
 
432 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  35.37 
 
 
433 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8896  Epoxide hydrolase domain protein  35.64 
 
 
367 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7708  epoxide hydrolase  35.53 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303595  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  33.16 
 
 
441 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  35.32 
 
 
442 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  34.45 
 
 
376 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2787  Microsomal epoxide hydrolase  33.25 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>