More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1982 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1982  epocide hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
393 aa  804    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5889  epocide hydrolase domain-containing protein  47.49 
 
 
376 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518696  normal  0.269579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1741  epocide hydrolase domain-containing protein  42.56 
 
 
398 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1728  epocide hydrolase domain-containing protein  39.29 
 
 
396 aa  282  9e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2927  Epoxide hydrolase domain-containing protein  37.08 
 
 
383 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000602149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5343  Epoxide hydrolase domain protein  36.8 
 
 
387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1727  epocide hydrolase domain-containing protein  36.92 
 
 
407 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1654  Epoxide hydrolase domain protein  37.21 
 
 
383 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572476  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5134  epocide hydrolase domain-containing protein  39.68 
 
 
423 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6643  Epoxide hydrolase domain protein  38.2 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3661  Epoxide hydrolase domain protein  36.92 
 
 
391 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1262  putative epoxide hydrolase  35.55 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0357  epocide hydrolase domain-containing protein  36 
 
 
369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5218  putative hydrolase  35.57 
 
 
378 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4356  Epoxide hydrolase domain protein  34.61 
 
 
383 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2898  putative epoxide hydrolase  34.91 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5635  epocide hydrolase domain-containing protein  37.95 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0081  epoxide hydrolase-like protein  34.34 
 
 
448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4550  Epoxide hydrolase domain protein  35.41 
 
 
389 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1662  epoxide hydrolase-like protein  37.1 
 
 
377 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1686  epocide hydrolase domain-containing protein  36.8 
 
 
380 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0521  epocide hydrolase domain-containing protein  36.8 
 
 
380 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1635  epocide hydrolase domain-containing protein  36.8 
 
 
380 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241571  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2230  epocide hydrolase domain-containing protein  36.8 
 
 
380 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0561  epocide hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 
377 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.570417  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0644  epocide hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 
377 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0205  Epoxide hydrolase domain protein  35.71 
 
 
383 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3210  epocide hydrolase domain-containing protein  36.39 
 
 
382 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4092  Epoxide hydrolase domain protein  35.81 
 
 
410 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1704  epoxide hydrolase-like  39.08 
 
 
383 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3304  Epoxide hydrolase domain-containing protein  36.55 
 
 
387 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2711  epocide hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
385 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.989475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5274  epocide hydrolase domain-containing protein  34.35 
 
 
383 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497721  normal  0.0552481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4059  epoxide hydrolase-like  35.34 
 
 
382 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4307  epocide hydrolase domain-containing protein  35.34 
 
 
382 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5680  Epoxide hydrolase domain protein  35.35 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5260  Epoxide hydrolase domain protein  34.1 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  35.68 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2381  Epoxide hydrolase domain protein  32.38 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000193433  hitchhiker  0.00121047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  36.24 
 
 
367 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4978  Microsomal epoxide hydrolase  32.74 
 
 
388 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3607  Epoxide hydrolase domain protein  39.35 
 
 
368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0489471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4440  epoxide hydrolase-like protein  34.79 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4527  epocide hydrolase domain-containing protein  34.79 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4821  epocide hydrolase domain-containing protein  34.79 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5829  Epoxide hydrolase domain-containing protein  35.34 
 
 
395 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2690  Epoxide hydrolase domain protein  33.88 
 
 
420 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4655  Epoxide hydrolase domain protein  32.33 
 
 
445 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.246703  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3356  epoxide hydrolase-like  36.87 
 
 
383 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21914  normal  0.116129 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5530  epocide hydrolase domain-containing protein  34.99 
 
 
431 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3503  epocide hydrolase domain-containing protein  32.91 
 
 
425 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.716412 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2266  epoxide hydrolase-like  34.65 
 
 
377 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1120  Epoxide hydrolase domain-containing protein  33.16 
 
 
374 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6678  Microsomal epoxide hydrolase  31.65 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2254  epoxide hydrolase-like  32.67 
 
 
444 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344199  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4015  epocide hydrolase domain-containing protein  32.49 
 
 
425 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.23367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1239  putative hydrolase  33.88 
 
 
393 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4940  epocide hydrolase domain-containing protein  33.42 
 
 
403 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23787  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6161  Microsomal epoxide hydrolase  32.91 
 
 
446 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1791  Epoxide hydrolase domain protein  31.34 
 
 
436 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2973  Microsomal epoxide hydrolase  31.31 
 
 
422 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5719  epocide hydrolase domain-containing protein  32.97 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  33.33 
 
 
503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5186  Epoxide hydrolase domain protein  34 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1749  epocide hydrolase domain-containing protein  34.66 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1058  epocide hydrolase domain-containing protein  34.56 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2648  epoxide hydrolase-like  32.41 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5264  epocide hydrolase domain-containing protein  32.16 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5700  epoxide hydrolase-like  32.05 
 
 
438 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530868  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2457  Epoxide hydrolase domain protein  31.45 
 
 
433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651202  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0254  Epoxide hydrolase domain protein  30.83 
 
 
429 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4037  Epoxide hydrolase domain protein  33.09 
 
 
435 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3443  epocide hydrolase domain-containing protein  31.91 
 
 
425 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6850  Microsomal epoxide hydrolase  33.7 
 
 
428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6857  Epoxide hydrolase domain protein  33.5 
 
 
431 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5519  epocide hydrolase domain-containing protein  32.75 
 
 
430 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  32.8 
 
 
409 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1075  epocide hydrolase domain-containing protein  31.95 
 
 
372 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.676666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1691  Epoxide hydrolase domain-containing protein  32.99 
 
 
377 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6244  epocide hydrolase domain-containing protein  33.61 
 
 
390 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4618  putative epoxide hydrolase  33.42 
 
 
399 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4292  Epoxide hydrolase domain protein  35.59 
 
 
362 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5100  putative hydrolase  31.19 
 
 
368 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3339  Epoxide hydrolase domain protein  32.32 
 
 
376 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3427  Epoxide hydrolase domain protein  28.81 
 
 
417 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000739358  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2855  Epoxide hydrolase domain protein  33.43 
 
 
409 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4599  putative hydrolase  31.67 
 
 
386 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5867  epocide hydrolase domain-containing protein  31.96 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4786  Epoxide hydrolase domain-containing protein  30.83 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.298579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0451  Microsomal epoxide hydrolase  31.84 
 
 
378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9243  putative hydrolase  32.64 
 
 
374 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1694  Epoxide hydrolase domain protein  30.94 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39912  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05262  Epoxide hydrolase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2KHJ7]  30.36 
 
 
419 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2787  Microsomal epoxide hydrolase  30.75 
 
 
384 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117815  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8642  Epoxide hydrolase domain protein  32.97 
 
 
376 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187531  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7708  epoxide hydrolase  31.34 
 
 
443 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303595  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1877  Epoxide hydrolase domain protein  33.72 
 
 
361 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119141  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1141  Epoxide hydrolase domain protein  32.29 
 
 
366 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104079  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5192  Epoxide hydrolase domain protein  30.17 
 
 
442 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.466116  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0154  Epoxide hydrolase domain protein  30.48 
 
 
376 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.696514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>