More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0528 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0528  ribonuclease  100 
 
 		 506 aa  1016    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0557829  normal  0.0741162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.08 
 
 		 531 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  42.25 
 
 		 503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  39.53 
 
 		 489 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  39.57 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  41.22 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  38.17 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  39.41 
 
 		 492 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  39.61 
 
 		 496 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  41.62 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.93 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  41.5 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  41.11 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  40.08 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  41.5 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  40.08 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  41.5 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.74 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  42.29 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  40.04 
 
 		 490 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  42.29 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.61 
 
 		 496 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  38.74 
 
 		 489 aa  327  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  40.71 
 
 		 485 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  38.51 
 
 		 503 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  38.7 
 
 		 491 aa  325  9e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  40.91 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  38.74 
 
 		 489 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  38.74 
 
 		 489 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  39.53 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  38.74 
 
 		 489 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  38.74 
 
 		 489 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  38.74 
 
 		 489 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  39.05 
 
 		 488 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  40.83 
 
 		 485 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  38.07 
 
 		 489 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  38.66 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  40.63 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  38.86 
 
 		 502 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  38.86 
 
 		 502 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  37.86 
 
 		 508 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  40.04 
 
 		 487 aa  319  7e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  38.66 
 
 		 488 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  38.37 
 
 		 490 aa  319  7.999999999999999e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  39.36 
 
 		 483 aa  319  9e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  37.94 
 
 		 489 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  37.38 
 
 		 485 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  40.91 
 
 		 493 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  41.54 
 
 		 484 aa  317  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  39.06 
 
 		 517 aa  316  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  38.26 
 
 		 502 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  38.26 
 
 		 488 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  38.26 
 
 		 488 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  38.26 
 
 		 502 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  36.91 
 
 		 497 aa  316  8e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  36.91 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  37.75 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  38.54 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  37.67 
 
 		 489 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  38.89 
 
 		 503 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  36.88 
 
 		 489 aa  312  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  37.75 
 
 		 489 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  36.4 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  37.48 
 
 		 496 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  37.55 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  38.22 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  36.54 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  38.42 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  39.69 
 
 		 500 aa  310  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  38.42 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  37.35 
 
 		 489 aa  309  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  38.7 
 
 		 502 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  38.22 
 
 		 489 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  38.22 
 
 		 489 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  38.22 
 
 		 489 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  38.66 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  37.21 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  37.5 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  36.69 
 
 		 530 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  37.02 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  38.54 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  37.15 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  38.69 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  38.75 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  35.42 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  37.57 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  37.57 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  37.57 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  37.75 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  37.01 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>