More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0605 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0605  ribosomal protein L2  100 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.397352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3159  50S ribosomal protein L2  70.22 
 
 		 279 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_002950  PG1935  50S ribosomal protein L2  68.61 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0394  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1150  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 275 aa  367  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000298819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05730  50S ribosomal protein L2  68.25 
 
 		 279 aa  367  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.144861  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0194  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.352427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5784  ribosomal protein L2  65.33 
 
 		 274 aa  358  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.091769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1618  ribosomal protein L2  64.71 
 
 		 277 aa  358  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 274 aa  358  7e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4346  ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 275 aa  342  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000143902  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 		 280 aa  335  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 274 aa  331  7.000000000000001e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 279 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  58.33 
 
 		 276 aa  329  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 277 aa  328  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  56.36 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  58.7 
 
 		 276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  58.18 
 
 		 275 aa  325  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 275 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  61.17 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  61.03 
 
 		 276 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 276 aa  321  7e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 276 aa  321  7e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  58.55 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  58.61 
 
 		 276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 274 aa  318  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 		 276 aa  318  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 274 aa  318  7e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  57.45 
 
 		 276 aa  317  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 274 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 275 aa  316  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  56.73 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 275 aa  312  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  57.45 
 
 		 275 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 		 273 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 274 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  56 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 287 aa  308  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  61.33 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 		 277 aa  308  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  56.16 
 
 		 276 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 275 aa  308  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 275 aa  308  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  56.63 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  56.46 
 
 		 287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  62.11 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 287 aa  305  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 277 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 277 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  54.35 
 
 		 276 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  56.09 
 
 		 287 aa  304  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 		 275 aa  304  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  56.09 
 
 		 287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  57.85 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0770  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00209717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  55.72 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  55.47 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  61.48 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 275 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  56.51 
 
 		 287 aa  301  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  54.81 
 
 		 287 aa  301  8.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  54.98 
 
 		 287 aa  301  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  57.78 
 
 		 279 aa  300  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  53.99 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  53.99 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  56.73 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 277 aa  298  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  54.01 
 
 		 283 aa  298  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>