More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0301 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  60.57 
 
 		 279 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  62.37 
 
 		 279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  61.65 
 
 		 279 aa  331  7.000000000000001e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  58.06 
 
 		 277 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  56.99 
 
 		 275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  64.5 
 
 		 264 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  65.27 
 
 		 264 aa  325  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  58.06 
 
 		 280 aa  324  9e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 276 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 		 276 aa  322  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  64.12 
 
 		 264 aa  322  6e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  56.88 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 276 aa  315  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  56.16 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 275 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3159  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  56.27 
 
 		 277 aa  308  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  55.91 
 
 		 277 aa  308  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  55.91 
 
 		 277 aa  308  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  55.43 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  54.51 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0605  ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.397352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  54.35 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 274 aa  306  3e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  56.16 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1935  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1618  ribosomal protein L2  54.84 
 
 		 277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 276 aa  305  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 276 aa  305  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  54.87 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  56.63 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  56.63 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  54.64 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  55.34 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  54.68 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5784  ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.091769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  58.27 
 
 		 275 aa  298  6e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0770  50S ribosomal protein L2  54.12 
 
 		 276 aa  298  7e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00209717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 282 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 282 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  53.79 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  52.69 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  53.99 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  54.48 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  53.07 
 
 		 274 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  51.61 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 278 aa  292  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  54.12 
 
 		 277 aa  292  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  51.61 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  51.61 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  53.11 
 
 		 287 aa  291  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  52.9 
 
 		 287 aa  291  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1150  50S ribosomal protein L2  54.35 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000298819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  53.79 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  56.16 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  53.11 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  55.23 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  53.99 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  54.35 
 
 		 275 aa  289  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  51.81 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  51.81 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  52.5 
 
 		 277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  53.76 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  51.26 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  53.05 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  52.71 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  53.11 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  51.45 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  52.69 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  51.26 
 
 		 273 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  51.26 
 
 		 273 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>