More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05730 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05730  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.144861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1150  50S ribosomal protein L2  79.2 
 
 		 275 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000298819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0394  50S ribosomal protein L2  79.93 
 
 		 274 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0605  ribosomal protein L2  68.25 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.397352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1935  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3159  50S ribosomal protein L2  65.34 
 
 		 279 aa  345  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0194  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 274 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.352427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5784  ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 274 aa  329  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.091769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  61.37 
 
 		 276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1618  ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 277 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  57.76 
 
 		 276 aa  316  3e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  58.21 
 
 		 279 aa  315  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 275 aa  315  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  57.04 
 
 		 276 aa  313  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  57.86 
 
 		 277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  56.23 
 
 		 280 aa  311  7.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  311  9e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  58.55 
 
 		 276 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 275 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  55.8 
 
 		 276 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4346  ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000143902  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  58.93 
 
 		 279 aa  302  5.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  55.23 
 
 		 276 aa  301  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  53.48 
 
 		 274 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  57.4 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 		 276 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 276 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 278 aa  298  7e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  55.23 
 
 		 276 aa  298  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 274 aa  298  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 274 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  55.76 
 
 		 277 aa  296  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  54.87 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  57.04 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 276 aa  293  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  56.27 
 
 		 282 aa  291  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  57.86 
 
 		 279 aa  291  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 274 aa  288  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  55.96 
 
 		 275 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 		 277 aa  288  9e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  54.68 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  54.68 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  52.84 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  52.84 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  53.05 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  53.05 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  56.11 
 
 		 274 aa  285  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  53.82 
 
 		 275 aa  285  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  53.65 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  52.13 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  53.68 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 281 aa  282  5.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  51.96 
 
 		 287 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  53.68 
 
 		 287 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  53.31 
 
 		 287 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  53.76 
 
 		 277 aa  281  6.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  51.81 
 
 		 283 aa  281  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  54.24 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  56.36 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  53.6 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  53.28 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  53.68 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  52.88 
 
 		 277 aa  279  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  53.43 
 
 		 276 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  53.7 
 
 		 287 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  52.38 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  52.73 
 
 		 276 aa  277  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  53.07 
 
 		 275 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2369  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.962452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0408  50S ribosomal protein L2  51.08 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000019918  normal  0.14889 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  51.07 
 
 		 279 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2166  ribosomal protein L2  52 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000491264  normal  0.227842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>