More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3159 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3159  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0605  ribosomal protein L2  70.22 
 
 
274 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.397352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1618  ribosomal protein L2  68.59 
 
 
277 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0194  50S ribosomal protein L2  68.75 
 
 
274 aa  371  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.352427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5784  ribosomal protein L2  69.85 
 
 
274 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.091769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0394  50S ribosomal protein L2  69.49 
 
 
274 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1150  50S ribosomal protein L2  67.03 
 
 
275 aa  365  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000298819  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1935  50S ribosomal protein L2  66.54 
 
 
274 aa  363  1e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4346  ribosomal protein L2  67.4 
 
 
275 aa  348  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000143902  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  63.97 
 
 
276 aa  347  9e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05730  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 
279 aa  346  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.144861  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
274 aa  343  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 
277 aa  332  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 
274 aa  330  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  59.14 
 
 
279 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 
274 aa  329  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
275 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 
274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  57.45 
 
 
276 aa  325  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  58.97 
 
 
273 aa  325  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 
275 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  58.61 
 
 
274 aa  324  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  58.46 
 
 
274 aa  323  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
276 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
276 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  55.11 
 
 
276 aa  322  5e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
274 aa  321  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 
274 aa  321  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
276 aa  321  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  56.57 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  55.11 
 
 
276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 
280 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 
276 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  58.76 
 
 
275 aa  318  9e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  58.97 
 
 
273 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  58.97 
 
 
273 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  58.03 
 
 
275 aa  316  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
277 aa  316  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
277 aa  316  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 
276 aa  316  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  59.14 
 
 
279 aa  316  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  56.16 
 
 
275 aa  315  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  55.84 
 
 
275 aa  315  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  59.34 
 
 
275 aa  314  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  58.18 
 
 
276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
276 aa  310  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  55.27 
 
 
275 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  59.43 
 
 
281 aa  310  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  56.78 
 
 
275 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 
276 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 
276 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  56.52 
 
 
276 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  56.92 
 
 
274 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 
276 aa  309  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 
275 aa  308  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
278 aa  308  9e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  54.71 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  55.27 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 
274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  56.99 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  59.35 
 
 
277 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  57.51 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 
287 aa  305  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  57.2 
 
 
287 aa  305  7e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  54.87 
 
 
277 aa  305  7e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  56.25 
 
 
273 aa  304  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  54.91 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  54.91 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  56.62 
 
 
273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  54.91 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  55.96 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  56.25 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  56.25 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  56.25 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  56.25 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  55.88 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  59.02 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  55.68 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  56.25 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  54.55 
 
 
274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  55.23 
 
 
277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  54.74 
 
 
276 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 
276 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  55.88 
 
 
273 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  55.88 
 
 
273 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>