233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3675 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3675  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 377 aa  772    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  65.6 
 
 		 361 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1952  AFG1 family ATPase  61.58 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0330753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2352  AFG1-family ATPase  62.84 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3343  AFG1 family ATPase  63.72 
 
 		 357 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58880  putative ATPase  50.42 
 
 		 363 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0491345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5175  AFG1 family ATPase  50.89 
 
 		 343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38240  AFG1-like ATPase  39.6 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  35.69 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  37.95 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  31.18 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  35.38 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  33.97 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  37.69 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  35.14 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  35.69 
 
 		 368 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  35.15 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  36.91 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  33.14 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  36.19 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  34.92 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  33.14 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  35.38 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  33.85 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  36.27 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  33.45 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3538  AFG1 family ATPase  35.26 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  36.69 
 
 		 358 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  32.16 
 
 		 387 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  34.39 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  34.57 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  35.39 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  36.36 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  33.14 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  33.12 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  32.76 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  36.04 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  32.76 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  32.46 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  35.57 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  33.24 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  33.33 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  35.08 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  32.95 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  33.14 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  33.11 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  35.02 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  35.02 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  35.02 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  32.77 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  32.67 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  32.67 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  35.79 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  32.2 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  32.96 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  34.7 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  34.12 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  31.25 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  31.81 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  34.7 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  34.7 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  33.77 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  34.7 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  34.93 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  34.78 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  33.85 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  34.64 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  34.16 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  34.09 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  33.22 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  34.09 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  34.09 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  30.97 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  30.97 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  35.12 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  33.13 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  30.97 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  30.97 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  31.62 
 
 		 366 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  33.13 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  31.62 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  31.62 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  30.68 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  34.38 
 
 		 393 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  33.76 
 
 		 364 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  31.52 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  32.49 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  35.74 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  33.13 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  32.21 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  34.5 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  34.7 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  32.49 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  34.71 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  31.53 
 
 		 367 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  35.03 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  36.07 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  32.39 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  31.44 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  33.97 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>