235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2352 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2352  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 375 aa  762    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1952  AFG1 family ATPase  91.57 
 
 		 356 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0330753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3343  AFG1 family ATPase  95.79 
 
 		 357 aa  701    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  82.02 
 
 		 361 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3675  AFG1-like ATPase  62.84 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58880  putative ATPase  51.18 
 
 		 363 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0491345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5175  AFG1 family ATPase  50.74 
 
 		 343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38240  AFG1-like ATPase  38.69 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  34.38 
 
 		 365 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  33.33 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  34 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  32.01 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  37.63 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  34.29 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  34.29 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  34.2 
 
 		 365 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  33.33 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  33.33 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  33.91 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  33.33 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  33.33 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  33.33 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  33.33 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  33.33 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  32.66 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  33.91 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  33.91 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  32.95 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  32.67 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  32.39 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  32.39 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  32.39 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  37.23 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  32.16 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  34.49 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  37.54 
 
 		 367 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  37.54 
 
 		 367 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  37.07 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  35.1 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  36.45 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5297  AFG1-family ATPase  34.42 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  30.7 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  33.89 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  34.63 
 
 		 403 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  34.63 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  35.74 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  33.94 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  36.67 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  31.58 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  32.7 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  36.49 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  32.66 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  30.95 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  36.66 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  32.65 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  33.67 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  34.78 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  33.56 
 
 		 374 aa  166  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  33.78 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  34.49 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  33.44 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  34.62 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  37.09 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  32.26 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  34.64 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  34.64 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  33.33 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  34.18 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  34.64 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  34.18 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  34.18 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  34.18 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  33.06 
 
 		 371 aa  162  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  38.35 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  32.54 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  33.44 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  32.56 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  34.16 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  33.44 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  33.44 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  35.76 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  35 
 
 		 376 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  36.9 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  33.67 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  35.58 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  35.92 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  33.15 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  30.33 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  36.58 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  36.79 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  32.09 
 
 		 373 aa  159  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  36.45 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  32.79 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  36.53 
 
 		 358 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  33.77 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  34.44 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  35.97 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  36.09 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  31.78 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  33.77 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>