234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_58880  putative ATPase  100 
 
 		 363 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0491345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5175  AFG1 family ATPase  81.58 
 
 		 343 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  51 
 
 		 361 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3675  AFG1-like ATPase  50.42 
 
 		 377 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2352  AFG1-family ATPase  51.18 
 
 		 375 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3343  AFG1 family ATPase  49.57 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1952  AFG1 family ATPase  50.44 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0330753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38240  AFG1-like ATPase  42.58 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  37.22 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  36.36 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  35.69 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  34.81 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  34.81 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  37.32 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  36.1 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  35.13 
 
 		 364 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  36.1 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  36.11 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  36.39 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  34.56 
 
 		 365 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  35.13 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  33.24 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  35.53 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  34.56 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  35.82 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  36.1 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  36.1 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  33.99 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  36.1 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  36.1 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  36.1 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  36.1 
 
 		 365 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  36.1 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  33.99 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  36.1 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  33.99 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  37.25 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  36.03 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  35.47 
 
 		 371 aa  199  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  35.98 
 
 		 365 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  35.98 
 
 		 365 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  35.82 
 
 		 365 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  34.96 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  35.77 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  32.87 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  35.69 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  33.43 
 
 		 371 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  35.88 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  35.53 
 
 		 365 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  33.88 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  32.68 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  35.53 
 
 		 365 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  36.16 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  35.33 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  35.47 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  38.93 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  35.43 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  35.43 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  33.24 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  36.31 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  34.92 
 
 		 367 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  35.77 
 
 		 368 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  34.67 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  34.53 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  32.57 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  30.56 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  30.56 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  31.73 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  31.92 
 
 		 400 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  34.08 
 
 		 373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  34.94 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  34.83 
 
 		 366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  32.51 
 
 		 400 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1823  AFG1 family ATPase  34.42 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2199  AFG1-family ATPase  34.69 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  36.62 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2586  hypothetical protein  33.04 
 
 		 360 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2713  hypothetical protein  32.74 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  31.04 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  36.88 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  35.08 
 
 		 401 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2579  AFG1-like ATPase  32.7 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3592  ATPase, putative  34.56 
 
 		 371 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.907313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3362  AFG1-like ATPase  34.16 
 
 		 371 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  34.76 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2909  hypothetical protein  33.5 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  32.61 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  36.54 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  36.54 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0870  AFG1 family ATPase  32.39 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  36.54 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  36.54 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  36.54 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  36.39 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  35.48 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  36.39 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  36.54 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  36.54 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  31.87 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  36.39 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>