234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38240 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_38240  AFG1-like ATPase  100 
 
 
360 aa  718    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  37.78 
 
 
371 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58880  putative ATPase  42.42 
 
 
363 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0491345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5175  AFG1 family ATPase  42.6 
 
 
343 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  38 
 
 
365 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  36.62 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  36.65 
 
 
365 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  39.58 
 
 
361 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3675  AFG1-like ATPase  39.6 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  36 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  36.39 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  36.1 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  36.1 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  35.59 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  35.71 
 
 
367 aa  212  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  35.82 
 
 
365 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  36.21 
 
 
365 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  38.22 
 
 
366 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  35.23 
 
 
365 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  35.82 
 
 
365 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  35.92 
 
 
365 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  35.92 
 
 
366 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  35.92 
 
 
366 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  35.92 
 
 
366 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  37.64 
 
 
367 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  35.92 
 
 
366 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  35.92 
 
 
366 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  35.92 
 
 
366 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  34.75 
 
 
367 aa  209  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1952  AFG1 family ATPase  38.62 
 
 
356 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0330753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  35.63 
 
 
365 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  40.48 
 
 
372 aa  206  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2352  AFG1-family ATPase  38.69 
 
 
375 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  35.84 
 
 
365 aa  205  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  37.64 
 
 
365 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3343  AFG1 family ATPase  38.39 
 
 
357 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  35.26 
 
 
377 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  37.13 
 
 
371 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  35.26 
 
 
365 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  35.9 
 
 
367 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  36.18 
 
 
369 aa  203  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  35.9 
 
 
367 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  36 
 
 
367 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  36.44 
 
 
371 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  34.68 
 
 
365 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  38.23 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  35.26 
 
 
365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  36.54 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  36.99 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  35.23 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  35.77 
 
 
388 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  34.93 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  35.14 
 
 
367 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  32.58 
 
 
367 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  31.87 
 
 
371 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  35.14 
 
 
367 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  33.8 
 
 
368 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  33.91 
 
 
366 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  35.23 
 
 
386 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  34.28 
 
 
370 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  34.94 
 
 
386 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  33.24 
 
 
370 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  34.38 
 
 
370 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  34.02 
 
 
364 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  33.43 
 
 
365 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  34.38 
 
 
370 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  34.38 
 
 
370 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  36.7 
 
 
364 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  36.7 
 
 
364 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  34.38 
 
 
370 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  34.9 
 
 
374 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  32.19 
 
 
366 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  33.73 
 
 
364 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  34.34 
 
 
364 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  33.71 
 
 
368 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  34 
 
 
368 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  33.71 
 
 
393 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  36.31 
 
 
361 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  30.17 
 
 
365 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  30.17 
 
 
392 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  32.28 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23860  ATPase  35.36 
 
 
401 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  32.89 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  32.25 
 
 
364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  32.55 
 
 
364 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  32.55 
 
 
364 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  33.53 
 
 
364 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  33.78 
 
 
372 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2713  hypothetical protein  31.9 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3269  AFG1 family ATPase  36.81 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588106  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3425  AFG1 family ATPase  34.05 
 
 
368 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3797  AFG1 family ATPase  34.42 
 
 
379 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.10446  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  30.68 
 
 
367 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  35.01 
 
 
360 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  34.97 
 
 
373 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2586  hypothetical protein  31.29 
 
 
360 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  35.83 
 
 
381 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  32.52 
 
 
341 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  36.04 
 
 
368 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  35.31 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>