234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1792 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1792  AFG1 family ATPase  100 
 
 		 361 aa  737    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1952  AFG1 family ATPase  83.15 
 
 		 356 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0330753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2352  AFG1-family ATPase  82.02 
 
 		 375 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3343  AFG1 family ATPase  82.3 
 
 		 357 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3675  AFG1-like ATPase  65.6 
 
 		 377 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58880  putative ATPase  51 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0491345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5175  AFG1 family ATPase  51.93 
 
 		 343 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38240  AFG1-like ATPase  39.58 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  32.49 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  32.01 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  33.52 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  34.78 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  32.75 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  33.33 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  36.7 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  33.05 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  36.74 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  33.05 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  33.05 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  33.05 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  33.05 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  33.05 
 
 		 365 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  35.81 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  36.31 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  33.05 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  32.76 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  35.69 
 
 		 365 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  35.78 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  35.69 
 
 		 365 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  35.47 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  35.47 
 
 		 365 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  34.3 
 
 		 387 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  34.3 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  35.23 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  37.28 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  34.1 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  35.93 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  31.39 
 
 		 371 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  36.98 
 
 		 393 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  32.99 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  38.91 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  33.44 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  30.2 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  33.02 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  36.36 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  36.12 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  36.12 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  32.65 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  37.06 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  36.36 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  35.93 
 
 		 365 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  33.44 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  34.15 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3756  ATPase  34.38 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  33.33 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  33.23 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  31.5 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  35.57 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  32.18 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  35.12 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0839  AFG1 family ATPase  34.02 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  32.68 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  31.23 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  32.68 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  31.74 
 
 		 372 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  37.08 
 
 		 404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  31.78 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  36.4 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  35.52 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  32.78 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  35.74 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  35.52 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  35.52 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  34.67 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5297  AFG1-family ATPase  33.73 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  35.47 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  36.23 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  34.69 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  36.4 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  37.5 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  35.14 
 
 		 371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  32.56 
 
 		 367 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  35.74 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  33.76 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  33.23 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  35.43 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  34.77 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3076  AFG1 family ATPase  32.54 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000204331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  32.55 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  32.32 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  35.93 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3102  AFG1 family ATPase  34.91 
 
 		 400 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  34.44 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  35.76 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  34.86 
 
 		 397 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  35.42 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  35.38 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  35.38 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  35.23 
 
 		 375 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>