37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2300 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2300  Oligogalacturonate-specific porin  100 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2001  Oligogalacturonate-specific porin  80.99 
 
 		 242 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2179  Oligogalacturonate-specific porin  68.75 
 
 		 240 aa  340  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.689905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2196  Oligogalacturonate-specific porin  62.81 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1903  Oligogalacturonate-specific porin  61.98 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2038  Oligogalacturonate-specific porin  58.16 
 
 		 237 aa  286  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0095  oligogalacturonate-specific porin  57.74 
 
 		 234 aa  284  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4063  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  57.74 
 
 		 234 aa  284  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.884359  normal  0.87941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4068  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  57.74 
 
 		 234 aa  284  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1965  Oligogalacturonate-specific porin  57.68 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1938  Oligogalacturonate-specific porin  58.68 
 
 		 242 aa  281  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2649  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  55.56 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.175281  normal  0.0875621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1797  oligogalacturonate-specific porin  55.56 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.28748  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1687  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  55.56 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.219149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0483  oligogalacturonate-specific porin  53.16 
 
 		 233 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3298  oligogalacturonate-specific porin  40.85 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.401974  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1206  oligogalacturonate-specific porin  35.27 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.259632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1226  oligogalacturonate-specific porin  35.68 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.715792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1241  oligogalacturonate-specific porin  35.68 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  0.418672 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1196  oligogalacturonate-specific porin  35.68 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4268  oligogalacturonate-specific porin  36.71 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4381  oligogalacturonate-specific porin  36.29 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4449  oligogalacturonate-specific porin  36.29 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4297  oligogalacturonate-specific porin  36.29 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4337  oligogalacturonate-specific porin  36.29 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0180015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3253  hypothetical protein  32.88 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1876  oligogalacturonate-specific porin  28.11 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0189  oligogalacturonate-specific porin  29.12 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000915  hypothetical protein  28.97 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04140  hypothetical protein  28.47 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4836  N-acetylneuraminic acid porin NanC  28.47 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4536  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  28.47 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3687  Oligogalacturonate-specific porin  28.47 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04178  N-acetylnuraminic acid outer membrane channel protein  28.47 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4910  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  28.47 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2169  Oligogalacturonate-specific porin  22.58 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2510  Oligogalacturonate-specific porin  22.18 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0628975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>