29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000915 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000915  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0189  oligogalacturonate-specific porin  36.14 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3298  oligogalacturonate-specific porin  33.47 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.401974  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4068  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  31.82 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0095  oligogalacturonate-specific porin  31.82 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4063  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  31.82 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.884359  normal  0.87941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1965  Oligogalacturonate-specific porin  32.03 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2196  Oligogalacturonate-specific porin  28.63 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0483  oligogalacturonate-specific porin  30.42 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1876  oligogalacturonate-specific porin  28.23 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1226  oligogalacturonate-specific porin  29.55 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.715792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1241  oligogalacturonate-specific porin  29.55 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  0.418672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1206  oligogalacturonate-specific porin  29.55 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.259632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4337  oligogalacturonate-specific porin  29.54 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0180015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4381  oligogalacturonate-specific porin  29.54 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4297  oligogalacturonate-specific porin  29.54 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4449  oligogalacturonate-specific porin  29.54 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1196  oligogalacturonate-specific porin  29.55 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4268  oligogalacturonate-specific porin  29.54 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2179  Oligogalacturonate-specific porin  28.34 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.689905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2038  Oligogalacturonate-specific porin  28.63 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2300  Oligogalacturonate-specific porin  28.97 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1903  Oligogalacturonate-specific porin  30.33 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1797  oligogalacturonate-specific porin  25.2 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.28748  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1687  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  25.2 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.219149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2649  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  25.2 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.175281  normal  0.0875621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2001  Oligogalacturonate-specific porin  27.84 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1938  Oligogalacturonate-specific porin  27.2 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3253  hypothetical protein  26.38 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>