33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1876 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1876  oligogalacturonate-specific porin  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3253  hypothetical protein  51.56 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3298  oligogalacturonate-specific porin  33.61 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.401974  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1196  oligogalacturonate-specific porin  31.12 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1241  oligogalacturonate-specific porin  32.46 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  0.418672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1226  oligogalacturonate-specific porin  32.46 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.715792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1206  oligogalacturonate-specific porin  32.02 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.259632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4449  oligogalacturonate-specific porin  31.36 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4297  oligogalacturonate-specific porin  31.36 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4268  oligogalacturonate-specific porin  31.36 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4381  oligogalacturonate-specific porin  31.36 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4337  oligogalacturonate-specific porin  31.36 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0180015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1965  Oligogalacturonate-specific porin  29.02 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2168  Oligogalacturonate-specific porin  26.47 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2300  Oligogalacturonate-specific porin  28.11 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2509  Oligogalacturonate-specific porin  26.28 
 
 		 352 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0095  oligogalacturonate-specific porin  28.57 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4063  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  28.57 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.884359  normal  0.87941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4068  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  28.57 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2179  Oligogalacturonate-specific porin  28.8 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.689905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0483  oligogalacturonate-specific porin  28.05 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2196  Oligogalacturonate-specific porin  27.67 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2038  Oligogalacturonate-specific porin  27.94 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2169  Oligogalacturonate-specific porin  24.71 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2510  Oligogalacturonate-specific porin  24.81 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0628975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1797  oligogalacturonate-specific porin  27.39 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.28748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2649  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  27.39 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.175281  normal  0.0875621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1687  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  27.39 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.219149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0189  oligogalacturonate-specific porin  29.33 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2001  Oligogalacturonate-specific porin  25.81 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1938  Oligogalacturonate-specific porin  25.6 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1903  Oligogalacturonate-specific porin  27.1 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000915  hypothetical protein  28.23 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>