31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0189 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0189  oligogalacturonate-specific porin  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000915  hypothetical protein  36.14 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3298  oligogalacturonate-specific porin  32.8 
 
 
228 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.401974  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4068  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  31.52 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4063  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  31.52 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.884359  normal  0.87941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0095  oligogalacturonate-specific porin  31.52 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2196  Oligogalacturonate-specific porin  28.96 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4449  oligogalacturonate-specific porin  30.62 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4297  oligogalacturonate-specific porin  30.62 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4337  oligogalacturonate-specific porin  30.62 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0180015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4381  oligogalacturonate-specific porin  30.62 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4268  oligogalacturonate-specific porin  30.62 
 
 
223 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1903  Oligogalacturonate-specific porin  31.15 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0483  oligogalacturonate-specific porin  30.58 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2038  Oligogalacturonate-specific porin  28.57 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2300  Oligogalacturonate-specific porin  29.12 
 
 
239 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1876  oligogalacturonate-specific porin  29.33 
 
 
241 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1797  oligogalacturonate-specific porin  27.06 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.28748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2649  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  27.06 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.175281  normal  0.0875621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1965  Oligogalacturonate-specific porin  36.88 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1687  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  27.06 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.219149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2001  Oligogalacturonate-specific porin  26.74 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1938  Oligogalacturonate-specific porin  24.9 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2179  Oligogalacturonate-specific porin  24.51 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.689905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3253  hypothetical protein  29.27 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1226  oligogalacturonate-specific porin  27.42 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.715792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1241  oligogalacturonate-specific porin  27.42 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  0.418672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1206  oligogalacturonate-specific porin  27.02 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.259632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1196  oligogalacturonate-specific porin  27.02 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2168  Oligogalacturonate-specific porin  26.39 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2509  Oligogalacturonate-specific porin  25.52 
 
 
352 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>