26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2509 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2509  Oligogalacturonate-specific porin  100 
 
 		 352 aa  726    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2168  Oligogalacturonate-specific porin  94.49 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2510  Oligogalacturonate-specific porin  28.22 
 
 		 254 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0628975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3253  hypothetical protein  29.46 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2169  Oligogalacturonate-specific porin  28.11 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1876  oligogalacturonate-specific porin  26.28 
 
 		 241 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1226  oligogalacturonate-specific porin  24.81 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.715792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1241  oligogalacturonate-specific porin  24.81 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  0.418672 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1196  oligogalacturonate-specific porin  25.64 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1206  oligogalacturonate-specific porin  24.43 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.259632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4268  oligogalacturonate-specific porin  22.82 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3298  oligogalacturonate-specific porin  25.19 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.401974  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4381  oligogalacturonate-specific porin  22.82 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4337  oligogalacturonate-specific porin  22.82 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0180015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4297  oligogalacturonate-specific porin  22.82 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4449  oligogalacturonate-specific porin  22.82 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1965  Oligogalacturonate-specific porin  25 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2038  Oligogalacturonate-specific porin  22.98 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1938  Oligogalacturonate-specific porin  22.3 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0483  oligogalacturonate-specific porin  22.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0189  oligogalacturonate-specific porin  25.52 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2196  Oligogalacturonate-specific porin  23.39 
 
 		 240 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2179  Oligogalacturonate-specific porin  24.9 
 
 		 240 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.689905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0095  oligogalacturonate-specific porin  18.73 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4063  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  18.73 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.884359  normal  0.87941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4068  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  18.73 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>