39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4910 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4910  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  100 
 
 		 238 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4536  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  99.16 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4836  N-acetylneuraminic acid porin NanC  99.16 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04140  hypothetical protein  99.16 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3687  Oligogalacturonate-specific porin  99.16 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04178  N-acetylnuraminic acid outer membrane channel protein  99.16 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5815  oligogalacturonate-specific porin protein  99.45 
 
 		 182 aa  377  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4111  Oligogalacturonate-specific porin  25.1 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1241  oligogalacturonate-specific porin  25.73 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  0.418672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1226  oligogalacturonate-specific porin  25.73 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.715792 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4260  outer membrane porin L  25.1 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4398  outer membrane porin L  24.69 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.955051  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1206  oligogalacturonate-specific porin  25.31 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.259632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1196  oligogalacturonate-specific porin  24.68 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03709  hypothetical protein  24.27 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5321  outer membrane porin L  24.69 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.68131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03760  predicted outer membrane porin L  24.27 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.650816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4292  outer membrane porin L  25.83 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4338  outer membrane porin L  25.42 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4226  outer membrane porin L  25.42 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4247  outer membrane porin L  25.42 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4404  outer membrane porin L  25.42 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.543506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1938  Oligogalacturonate-specific porin  24.5 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2169  Oligogalacturonate-specific porin  23.19 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2510  Oligogalacturonate-specific porin  23.19 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0628975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2001  Oligogalacturonate-specific porin  23.72 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2038  Oligogalacturonate-specific porin  21.51 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3298  oligogalacturonate-specific porin  24.5 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.401974  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0483  oligogalacturonate-specific porin  21.99 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2300  Oligogalacturonate-specific porin  28.47 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3253  hypothetical protein  22.34 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1797  oligogalacturonate-specific porin  21.03 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.28748  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1687  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  21.03 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.219149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2649  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  21.03 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.175281  normal  0.0875621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4068  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  22.83 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4063  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  22.83 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.884359  normal  0.87941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0095  oligogalacturonate-specific porin  22.83 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2179  Oligogalacturonate-specific porin  25.1 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.689905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1965  Oligogalacturonate-specific porin  21.96 
 
 		 239 aa  42  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>