27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5815 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04178  N-acetylnuraminic acid outer membrane channel protein  100 
 
 		 238 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3687  Oligogalacturonate-specific porin  100 
 
 		 238 aa  380  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04140  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4536  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  100 
 
 		 238 aa  380  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4836  N-acetylneuraminic acid porin NanC  100 
 
 		 238 aa  380  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5815  oligogalacturonate-specific porin protein  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4910  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  99.45 
 
 		 238 aa  377  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03709  hypothetical protein  26.14 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03760  predicted outer membrane porin L  26.14 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.650816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4260  outer membrane porin L  26.8 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4111  Oligogalacturonate-specific porin  26.14 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5321  outer membrane porin L  26.8 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.68131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4398  outer membrane porin L  26.14 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.955051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4226  outer membrane porin L  26.14 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4292  outer membrane porin L  26.14 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4338  outer membrane porin L  26.14 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4247  outer membrane porin L  26.14 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4404  outer membrane porin L  26.14 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.543506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1226  oligogalacturonate-specific porin  22.81 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.715792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1241  oligogalacturonate-specific porin  22.81 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  0.418672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2169  Oligogalacturonate-specific porin  24.5 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1196  oligogalacturonate-specific porin  22.22 
 
 		 230 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2510  Oligogalacturonate-specific porin  25.26 
 
 		 254 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0628975  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1206  oligogalacturonate-specific porin  22.22 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.259632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2038  Oligogalacturonate-specific porin  22.09 
 
 		 237 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1938  Oligogalacturonate-specific porin  25.15 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1965  Oligogalacturonate-specific porin  23.3 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>