19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4260 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4260  outer membrane porin L  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5321  outer membrane porin L  99.13 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.68131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4398  outer membrane porin L  94.35 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.955051  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03709  hypothetical protein  93.91 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5456  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4111  Oligogalacturonate-specific porin  93.91 
 
 		 230 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03760  predicted outer membrane porin L  93.91 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.650816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4404  outer membrane porin L  90.87 
 
 		 230 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.543506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4338  outer membrane porin L  90.87 
 
 		 230 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4247  outer membrane porin L  90.87 
 
 		 230 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4292  outer membrane porin L  90.43 
 
 		 230 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4226  outer membrane porin L  90.43 
 
 		 230 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4910  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  25.1 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4836  N-acetylneuraminic acid porin NanC  25.11 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04140  hypothetical protein  25.11 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4536  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  25.11 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3687  Oligogalacturonate-specific porin  25.11 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04178  N-acetylnuraminic acid outer membrane channel protein  25.11 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5815  oligogalacturonate-specific porin protein  26.8 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3298  oligogalacturonate-specific porin  21.3 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.401974  normal  0.45062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>