46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04140 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04178  N-acetylnuraminic acid outer membrane channel protein  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3687  Oligogalacturonate-specific porin  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4836  N-acetylneuraminic acid porin NanC  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4536  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04140  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4910  oligogalacturonate-specific porin protein (KdgM)  99.16 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5815  oligogalacturonate-specific porin protein  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1241  oligogalacturonate-specific porin  26.14 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  0.418672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1226  oligogalacturonate-specific porin  26.14 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.715792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1206  oligogalacturonate-specific porin  25.73 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.259632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1196  oligogalacturonate-specific porin  25.11 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4111  Oligogalacturonate-specific porin  25.11 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4260  outer membrane porin L  25.11 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4398  outer membrane porin L  24.68 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.955051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5321  outer membrane porin L  24.78 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.68131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03760  predicted outer membrane porin L  24.35 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.650816  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03709  hypothetical protein  24.35 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5456  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4292  outer membrane porin L  25.83 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4226  outer membrane porin L  25.42 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4404  outer membrane porin L  25.42 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.543506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4247  outer membrane porin L  25.42 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4338  outer membrane porin L  25.42 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2001  Oligogalacturonate-specific porin  24.51 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2169  Oligogalacturonate-specific porin  23.57 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2510  Oligogalacturonate-specific porin  23.57 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0628975  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1938  Oligogalacturonate-specific porin  24.9 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3298  oligogalacturonate-specific porin  24.9 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.401974  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2038  Oligogalacturonate-specific porin  22.36 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0483  oligogalacturonate-specific porin  22.41 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2300  Oligogalacturonate-specific porin  28.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1797  oligogalacturonate-specific porin  21.46 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.28748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2649  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  21.46 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.175281  normal  0.0875621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1687  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  21.46 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.219149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0095  oligogalacturonate-specific porin  23.5 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2179  Oligogalacturonate-specific porin  25.6 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.689905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4063  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  23.5 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.884359  normal  0.87941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4068  oligogalacturonate-specific porin protein KdgM  23.5 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1965  Oligogalacturonate-specific porin  23.6 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3253  hypothetical protein  23.04 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4268  oligogalacturonate-specific porin  23.73 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2168  Oligogalacturonate-specific porin  24 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4449  oligogalacturonate-specific porin  23.73 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4297  oligogalacturonate-specific porin  23.73 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4337  oligogalacturonate-specific porin  23.73 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0180015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4381  oligogalacturonate-specific porin  23.73 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2196  Oligogalacturonate-specific porin  24.63 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>